MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Megasphaera elsdenii DSM 20460

Total Repeats: 46194

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_015873	CGGCTG	2	12	258696	258707	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	348025472
5002	NC_015873	CCA	2	6	258766	258771	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	348025472
5003	NC_015873	TCCT	2	8	258791	258798	0 %	50 %	0 %	50 %	348025472
5004	NC_015873	GAC	2	6	258800	258805	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	348025472
5005	NC_015873	TCA	2	6	258825	258830	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	348025472
5006	NC_015873	TTC	2	6	258866	258871	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	348025473
5007	NC_015873	CCCTGT	2	12	258891	258902	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	348025473
5008	NC_015873	GCG	2	6	258963	258968	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	348025473
5009	NC_015873	CCG	2	6	259017	259022	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	348025473
5010	NC_015873	GAT	2	6	259028	259033	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	348025473
5011	NC_015873	GGC	2	6	259057	259062	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	348025473
5012	NC_015873	GAC	2	6	259250	259255	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	348025473
5013	NC_015873	CGG	2	6	259302	259307	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	348025473
5014	NC_015873	TGG	2	6	259356	259361	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	348025473
5015	NC_015873	GTC	2	6	259364	259369	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	348025473
5016	NC_015873	TGC	2	6	259372	259377	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	348025473
5017	NC_015873	GCC	3	9	259382	259390	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	348025473
5018	NC_015873	GAC	2	6	259430	259435	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	348025473
5019	NC_015873	AGA	2	6	259480	259485	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	348025473
5020	NC_015873	TCG	2	6	259491	259496	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	348025473
5021	NC_015873	GTC	2	6	259535	259540	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	348025473
5022	NC_015873	GAC	2	6	259574	259579	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	348025473
5023	NC_015873	TTC	2	6	259726	259731	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	348025474
5024	NC_015873	TCG	2	6	259735	259740	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	348025474
5025	NC_015873	TGC	2	6	259742	259747	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	348025474
5026	NC_015873	GCC	2	6	259752	259757	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	348025474
5027	NC_015873	GCT	2	6	259784	259789	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	348025474
5028	NC_015873	GCTG	2	8	259793	259800	0 %	25 %	50 %	25 %	348025474
5029	NC_015873	CGGTC	2	10	259815	259824	0 %	20 %	40 %	40 %	348025474
5030	NC_015873	CTT	2	6	259905	259910	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	348025474
5031	NC_015873	CGA	2	6	259940	259945	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	348025474
5032	NC_015873	GAT	2	6	260040	260045	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	348025474
5033	NC_015873	CTT	2	6	260084	260089	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	348025474
5034	NC_015873	GCC	3	9	260100	260108	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	348025474
5035	NC_015873	GAT	2	6	260148	260153	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	348025474
5036	NC_015873	CGA	2	6	260195	260200	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	348025474
5037	NC_015873	GGA	2	6	260204	260209	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	348025474
5038	NC_015873	CAC	2	6	260227	260232	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	348025474
5039	NC_015873	GCG	2	6	260239	260244	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	348025474
5040	NC_015873	CGT	2	6	260265	260270	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	348025474
5041	NC_015873	GTC	2	6	260274	260279	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	348025474
5042	NC_015873	TTC	2	6	260357	260362	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	348025475
5043	NC_015873	CGA	2	6	260373	260378	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	348025475
5044	NC_015873	ATTC	2	8	260601	260608	25 %	50 %	0 %	25 %	348025475
5045	NC_015873	GAA	2	6	260740	260745	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	348025475
5046	NC_015873	TCA	2	6	260964	260969	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	348025475
5047	NC_015873	CTT	2	6	261023	261028	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	348025476
5048	NC_015873	CGA	2	6	261062	261067	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	348025476
5049	NC_015873	TGG	2	6	261070	261075	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	348025476
5050	NC_015873	CGGC	2	8	261213	261220	0 %	0 %	50 %	50 %	348025476
5051	NC_015873	CTT	2	6	261294	261299	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	348025476
5052	NC_015873	CGTGGA	2	12	261383	261394	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	348025476
5053	NC_015873	AGG	2	6	261424	261429	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	348025476
5054	NC_015873	TCA	2	6	261431	261436	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	348025476
5055	NC_015873	GAA	2	6	261444	261449	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	348025476
5056	NC_015873	CGT	2	6	261459	261464	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	348025476
5057	NC_015873	CCG	2	6	261466	261471	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	348025476
5058	NC_015873	CCT	2	6	261561	261566	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	348025477
5059	NC_015873	CGA	2	6	261579	261584	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	348025477
5060	NC_015873	GAC	2	6	261592	261597	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	348025477
5061	NC_015873	GCAG	2	8	261621	261628	25 %	0 %	50 %	25 %	348025477
5062	NC_015873	TGC	2	6	261640	261645	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	348025477
5063	NC_015873	CGT	2	6	261672	261677	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	348025477
5064	NC_015873	GGCCG	2	10	261694	261703	0 %	0 %	60 %	40 %	348025477
5065	NC_015873	TCG	2	6	261729	261734	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	348025477
5066	NC_015873	GGA	2	6	261806	261811	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	348025477
5067	NC_015873	TGT	2	6	261813	261818	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	348025477
5068	NC_015873	GGC	2	6	261847	261852	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	348025477
5069	NC_015873	GGC	2	6	261856	261861	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	348025477
5070	NC_015873	TGA	2	6	262023	262028	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	348025477
5071	NC_015873	TCG	2	6	262061	262066	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	348025477
5072	NC_015873	GAC	2	6	262069	262074	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	348025477
5073	NC_015873	GCA	2	6	262119	262124	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	348025477
5074	NC_015873	GTT	2	6	262138	262143	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	348025477
5075	NC_015873	GTCGCG	2	12	262201	262212	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	348025477
5076	NC_015873	GAC	2	6	262240	262245	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	348025477
5077	NC_015873	AGG	2	6	262304	262309	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	348025477
5078	NC_015873	ATG	2	6	262337	262342	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	348025477
5079	NC_015873	TGA	2	6	262347	262352	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	348025477
5080	NC_015873	TCA	2	6	262355	262360	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	348025477
5081	NC_015873	TTC	2	6	262426	262431	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	348025477
5082	NC_015873	ACG	2	6	262455	262460	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	348025477
5083	NC_015873	TGA	2	6	262539	262544	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	348025477
5084	NC_015873	GAC	2	6	262567	262572	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	348025477
5085	NC_015873	TTA	2	6	262610	262615	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	348025477
5086	NC_015873	TCC	2	6	262627	262632	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	348025478
5087	NC_015873	AGG	2	6	262725	262730	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	348025478
5088	NC_015873	CTG	2	6	262731	262736	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	348025478
5089	NC_015873	CGA	2	6	262766	262771	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	348025478
5090	NC_015873	GCC	2	6	262776	262781	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	348025478
5091	NC_015873	AGT	2	6	262819	262824	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	348025478
5092	NC_015873	T	6	6	262879	262884	0 %	100 %	0 %	0 %	348025478
5093	NC_015873	ATA	2	6	262944	262949	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	348025478
5094	NC_015873	GAA	2	6	262979	262984	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	348025478
5095	NC_015873	TTC	2	6	263033	263038	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	348025478
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5098	NC_015873	AGG	2	6	263136	263141	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	348025478
5099	NC_015873	CGA	2	6	263275	263280	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	348025478
5100	NC_015873	AGC	2	6	263315	263320	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	348025478
5101	NC_015873	CCG	2	6	263340	263345	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	348025478
5102	NC_015873	GGC	2	6	263421	263426	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	348025478
5103	NC_015873	GGACG	2	10	263441	263450	20 %	0 %	60 %	20 %	348025478
5104	NC_015873	GCC	2	6	263507	263512	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	348025478
5105	NC_015873	GGC	2	6	263630	263635	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	348025478
5106	NC_015873	CTT	2	6	263638	263643	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	348025478
5107	NC_015873	CGA	2	6	263668	263673	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	348025478
5108	NC_015873	CGG	2	6	263680	263685	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	348025478
5109	NC_015873	TTC	2	6	263693	263698	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	348025478
5110	NC_015873	CGC	2	6	263767	263772	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	348025478
5111	NC_015873	GCG	2	6	263849	263854	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	348025478
5112	NC_015873	GCT	2	6	263957	263962	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	348025479
5113	NC_015873	CAA	2	6	264077	264082	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	348025479
5114	NC_015873	CGA	2	6	264086	264091	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	348025479
5115	NC_015873	CGA	2	6	264107	264112	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	348025479
5116	NC_015873	TGA	2	6	264143	264148	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	348025479
5117	NC_015873	CTT	2	6	264237	264242	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	348025479
5118	NC_015873	CGA	2	6	264344	264349	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	348025479
5119	NC_015873	CAG	2	6	264359	264364	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	348025479
5120	NC_015873	CGC	2	6	264365	264370	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	348025479
5121	NC_015873	TTC	2	6	264456	264461	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	348025479
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5124	NC_015873	GATA	2	8	264630	264637	50 %	25 %	25 %	0 %	348025480
5125	NC_015873	CGC	2	6	264654	264659	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	348025480
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5137	NC_015873	CTG	2	6	265594	265599	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	348025480
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5149	NC_015873	CTT	2	6	266048	266053	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	348025481
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5155	NC_015873	TCA	2	6	266433	266438	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	348025482
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5160	NC_015873	GAAT	2	8	266549	266556	50 %	25 %	25 %	0 %	348025482
5161	NC_015873	TAT	2	6	266574	266579	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	348025483
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5226	NC_015873	ACGGCG	2	12	269781	269792	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	348025487
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5233	NC_015873	CCGTCA	2	12	270085	270096	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	348025487
5234	NC_015873	CGT	2	6	270128	270133	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	348025487
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5356	NC_015873	GCC	2	6	277679	277684	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	348025493
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5460	NC_015873	TCG	2	6	283619	283624	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	348025498
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5472	NC_015873	GTT	2	6	284236	284241	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	348025498
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5474	NC_015873	TAG	2	6	284327	284332	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	348025498
5475	NC_015873	GACG	2	8	284339	284346	25 %	0 %	50 %	25 %	348025498
5476	NC_015873	TCAT	2	8	284438	284445	25 %	50 %	0 %	25 %	348025498
5477	NC_015873	TA	3	6	284458	284463	50 %	50 %	0 %	0 %	348025498
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5491	NC_015873	GTC	2	6	284846	284851	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	348025499
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